■

http://hp.vector.co.jp/authors/VA028375/thebe/を使い始めた。

色分けの設定は、「構文解析」でできる。ヘルプには設定の詳細がないので適当に使ってみたところ次のような意味になるようだ。
TeXのMath環境(インライン数式)のハイライト設定例:

Plain $ Math Math
Math $ Math Plain

文字列には色クラス名（勝手に命名）が設定されていて、デフォルトでは Plain
第1カラムは、マッチを考える色クラス。第2カラムは、マッチングパターン、第3カラムはマッチした文字列に与える色クラス、第4カラムは以降に与える色クラス。
で、あってるかな？うまく行ってるからあってるんだろう。
これだけだと、$$に効かないので、

Plain $$ Equation Equation
Equation $$ Equation Plain

を作ればOK。マッチングの優先順位とかはどうなってるのかな？？　ちなみに Math と Equation は自分で定義した。
コメントは

Plain % Comment1 Comment1
Comment1 \n Comment1 Plain